1、制備含MMP底物蛋白的SDS-PAGE凝膠:推薦分離膠濃度為8%。分別在濃縮膠和分離膠中額外加入10×substrateG并使之稀釋10倍,混勻后加入過硫酸銨和TEMED,等待凝膠聚合。
2、待測樣品:切勿加熱變性,并且僅使用不加還原劑的上樣緩沖液。可通過預試驗確定加樣量,使用普通蛋白預染Marker即可。
3、低電流恒流電泳,每一塊小膠電流為20mA/gel。溴酚藍跑出凝膠前沿時結束電泳。
4、洗滌凝膠:取出凝膠,去除濃縮膠,放入容器內.可先用適量蒸餾水沖洗凝膠,然后加入10ml1×BufferA(用蒸餾水稀釋),室溫漂洗凝膠2×30分鐘。中間換液。
5、孵育:加入10ml1×BufferB(蒸餾水稀釋),室溫或37ºC孵育1~5小時。陽性對照或者血中的MMP通常37ºC孵育1小時即可顯示。如MMP活性低,應延長孵育時間為10小時或過一夜。
6、顯色:倒掉BufferB,加入凝膠蛋白質考馬斯亮藍染色液。凝膠的大部分區域被深染,在有MMP條帶的位置不被染色而形成透亮區域。透明區域的位置和范圍指示MMP-2、MMP-9的大小位置(酶譜)及活性。
7、條帶掃描:將凝膠放在掃描儀上掃描。雖然MMP條帶透明,但凝膠背景并非真正全黑。解決辦法:可用非透射光掃描,或用軟件圖像處理程序調整背景顯示為灰度顯示,并盡量設置為黑色.MMP條帶則為白色。